Это альтернативная версия известной истории, где события разворачиваются до начала оригинального сюжета. Сид пока остается обычным человеком, Кид еще не стал студентом академии, а Медуза лишь начинает свой путь в роли медсестры. Главная героиня — загадочное оружие Цугуми — еще не раскрыла свой потенциал и не принимала форму смертоносного клинка. Ее жизнь резко меняется, когда она встречает двух необычных наставниц — Аню и Мэмэ, которые помогают ей понять свою природу.
Вместе они попадают в экспериментальный класс «НОТ», где учатся управлять своими способностями и работать в команде. Здесь их ждут не только тренировки, но и первые серьезные испытания. Цугуми предстоит столкнуться с внутренними демонами, пока она пытается осознать свою истинную сущность. Аня и Мэмэ, в свою очередь, раскрывают перед ней мир, полный опасностей и тайн, где каждое решение может изменить будущее. Постепенно героиня начинает осознавать, что значит быть оружием в руках мастера.
Сюжет балансирует между драмой, экшеном и элементами мистики, раскрывая предысторию знакомых персонажей в новом свете. Зрители увидят, как формировались их личности, какие испытания они проходили до основных событий оригинала. История фокусируется на становлении Цугуми, ее отношениях с наставницами и первыми союзниками. Класс «НОТ» становится для нее не просто учебным заведением, а местом, где она находит себя и определяет свою судьбу в этом жестоком, но увлекательном мире.