Тайваньская наёмница по прозвищу Стеклянное Сердце решает свести счёты с жизнью, бросившись с высотного здания. Но судьба распоряжается иначе — вместо мгновенной смерти она оказывается на металлических прутьях ограды, получая тяжёлые повреждения сердца. Благодаря экстренной пересадке донорского органа девушка выживает, однако во время комы её посещают загадочные видения, которые впоследствии приводят её в Японию. Там она начинает поиски человека, чьё сердце теперь бьётся в её груди — Каори Макимуры, бывшей напарницы легендарного Городского охотника.
Создатели подчёркивают, что «Сердце ангела» — это самостоятельная история, использующая лишь образы персонажей из «Городского охотника», но не являющаяся его прямым продолжением. Действие разворачивается в альтернативной реальности, где судьбы героев складываются совершенно иначе. Главная героиня, пережившая клиническую смерть и мистические переживания, отправляется в Токио, чтобы разгадать тайну своих снов и найти того, кто подарил ей вторую жизнь.
Сюжет балансирует на грани детектива и психологической драмы, исследуя темы идентичности, памяти и искупления. Девушка с чужим сердцем сталкивается не только с внешними опасностями, но и с внутренними конфликтами, пытаясь понять, кто она теперь — холодная убийца или человек, получивший шанс начать всё заново. Встречи с персонажами из прошлого Каори добавляют истории глубины, создавая сложную паутину взаимоотношений, где каждый скрывает свои тайны.